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作者：杨银柯;钟干芳;徐俊贤;蓝天;林静佳;徐建华;张薇;曾汉日;李柏生;郑焕英;
单位：广州市白云区疾病预防控制中心;清远市第二人民医院;广东省疾病预防控制中心;
摘要：分析2023年广东省急性出血性结膜炎（Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC）疫情流行末期病原体组成及其分子特征情况，为AHC的防治提供科学依据。本研究采集AHC流行末期81份AHC患者眼结膜拭子，采用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,qPCR)方法，对其进行人肠道病毒70型（Human enterovirus 70,HEV70）、柯萨奇病毒A组24型变异株（Coxsackievirus A24 variant,CVA24v）和腺病毒（Adenovirus,AdV）核酸检测。通过HEp-2细胞进行病毒分离。对分离株进行PCR扩增和基因测序。用Mega11和BioEdit软件进行基因进化分析，用SWISS-MODEL进行VP1蛋白三维结构分析，通过IEDB进行VP1蛋白的B细胞抗原表位预测。结果显示81份眼拭子样本荧光定量PCR检测，EV70全部阴性，20份样本CVA24v阳性，16份样本AdV阳性。使用HEp-2细胞成功分离到8株CVA24v毒株。基于分子测序分析发现，2023年AHC流行末期的CVA24v病毒株与5月份疫情初期病毒株相比，8株CVA24v毒株在3C区核苷酸共有7处突变，其中在第309位点共享同义突变C→T。在VP1区共有19处突变，除AHC705/GD/CHN/2023株外，其余7株在第30位点共享同义突变T→C。此外还获得一株CVA24v的全基因组序列，和流行初期病毒株全长序列相比有24个核苷酸突变，3个氨基酸突变。本研究通过分析VP1蛋白的三维结构预测，识别出了本次疫情流行末期相比早期出现三个变异位点，其中T98A和A146T两个位点位于蛋白表面，参与组成抗原决定簇。研究结果显示，与疫情初期由CVA24v独立引起的流行相比，流行末期出现了CVA24v与AdV共同流行的现象。这一发现对理解病毒变异与流行动态具有重要意义。
关键词：急性出血性结膜炎;柯萨奇病毒A组24型变异株;腺病毒;基因进化分析
