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病毒学报2024年第05期:HRM技术快速检测新冠病毒变异株

来源:期刊VIP网 时间:


作者:周玉真;程悦;谢汶君;何迅;沈丹芸;陈恒;

单位:中国医学科学院成都新发突发传染病防治工作站;成都市疾病预防控制中心;

摘要:建立基于高分辨率融解曲线(High resolution melting,HRM)的快速检测新冠病毒变异株的方法,为新冠变异株快速检测提供技术支撑。针对新冠病毒S基因的氨基酸突变位点G339H/D、D796Y、V83A设计HRM引物,将新冠病毒实时定量荧光PCR(RT-PCR)阳性的核酸逆转录后进行HRM分析,并对33份新冠病毒RT-PCR阳性核酸标本进行检测,与二代测序结果进行比较。建立的HRM方法能区分Delta、Omicron及XBB亚型,33份标本的HRM分析结果显示其中2份为Delta株,31份为Omicron株,12份为XBB亚型。HRM分析结果与二代测序结果一致。本实验建立的HRM方法能够准确检测出新冠病毒变异株中的Delta、Omicron及XBB亚型,可应用于快速鉴定新冠病毒型别。

关键词:新冠变异株;高分辨率融解曲线;德塔尔株;奥密克戎株;XBB

基金资助:四川省医学青年创新科研课题计划(项目号:Q22017),题目:新型冠状病毒宿主内适应性进化及其应用研究; 2022年成都市医学科研课题(项目号:2022056),题目:基于突变位点库的新冠病毒变异株快速检测及溯源平台~~