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作者：龙森;纪峰;林小娟;刘尧;陶泽新;徐爱强;
单位：山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院;山东省疾病预防控制中心;
摘要：札如病毒（Sapovirus, SaV）具有高度的遗传多样，是引起散发或暴发病毒性胃肠炎的重要病原体之一。为了解中国东部地区人类SaV的流行情况及其基因型多样性，本研究于2020年1月至2022年12月，在山东省济南市采集并处理了36份污水样本，实时荧光定量RT-PCR检测显示33份（91.67%）污水样本为阳性；使用巢式RT-PCR对部分VP1序列进行扩增，电泳显示16份样本为阳性（44.4%）；对扩增产物分别进行下一代测序（Next generation sequencing, NGS）和分析，共鉴定出7种SaV基因型，属于GI、GII和GV三个基因群，包括5种主要基因型（GI.1、GI.2、GI.6、GII.1和GV.1）和2种不常见的基因型（GII.3和GII.5）；研究期间内，优势基因型在2021年4月前后由GI.2型转换为GI.1型。基于部分VP1序列的系统发生学分析显示本地序列和外来序列在某些分支中聚集，具有密切的亲缘关系。本研究丰富了新冠疫情以来三年内札如病毒的分子流行病学特征，证明了基于NGS的环境污水监测可以增加人们对SaV流行状况的认识，对深入研究我国SaV的分布及流行具有重大意义。
关键词：人类札如病毒;环境监测;下一代测序;分子流行病学
基金资助：泰山学者青年专家计划项目（项目号：tsqn202103187）,题目：基于同一健康理念和下一代测序技术新型病毒的发现、溯源和进化动态研究; 国家自然科学基金面上项目（项目号：81573209）,题目：环境污水中人类胃肠炎病毒的型别多样性、遗传进化规律及其与人群疾病发生的关系~~
