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作者：陈建华;于德山;武海卓;赵哲;赵晓虹;张勇;张晓曙;
单位：甘肃省疾病预防控制中心,甘肃省传染病病原学重点实验室;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室,国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室;
摘要：为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎（Herpangina,HA）暴发疫情的致病病原体及其病原学特征，对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养，然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列，根据分子定型的方法进行肠道病毒型别鉴定。根据VP1区核苷酸差异选择3个毒株进行二代测序，获取全基因组序列。使用MEGA软件（版本号11.0）进行病毒的核苷酸，氨基酸相似性分析，VP1区的氨基酸突变位点分析，并构建系统发育树，使用Simplot（版本号3.5.1）软件进行病毒重组分析。本次疫情中分离到的毒株鉴定为柯萨奇病毒A2型（Coxsackievirus A 2, CV-A2），分子分型显示属于D基因型，且VP1区第102位氨基酸发生了丙氨酸到甘氨酸（A102G）的突变，与省内2014-2015年分离到的两株CV-A2毒株在该位置的突变不同。重组分析发现，病毒在P2区和P3区发生了以CV-A4为主的重组事件。本次疫情的致病病原体CV-A2存在着VP1区氨基酸A102G的特征性变异及P2区和P3区的重组，需要加强对肠道病毒的变异和重组的监测和研究，以提升预警能力。
关键词：疱疹性咽峡炎;柯萨奇病毒A2型;基因组;特征性突变;重组变异;分子流行病学
基金资助：甘肃省自然科学基金项目（No.20JR5RA142）,题目：甘肃省疱疹性咽峡炎病原学监测研究; 甘肃省卫生行业科研计划项目（No.GSWSKY2017-23）,题目：外环境脊髓灰质炎病毒和其他肠道病毒病原学检测及分子流行病学特征性研究~~
