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作者:陈正灏;周胜花;薛丽娜;艾小楠;白璞;孟德荣;
单位:山西农业大学动物科学学院;山西省灵丘县畜牧兽医工作站;
摘要:试验旨在克隆获得灵丘青背山羊ELOVL6基因编码序列(CDS)并进行生物信息学分析,探究其mRNA组织表达特性。选用12月龄4只灵丘青背山羊公羊,对灵丘青背山羊ELOVL6基因编码区序列进行克隆,并使用在线软件预测和分析其编码氨基酸序列的生物信息学特征,利用实时荧光定量PCR技术测定ELOVL6基因在灵丘青背山羊不同组织中的表达水平。本试验成功克隆出灵丘青背山羊ELOVL6基因,其编码区长度为795 bp,编码264个氨基酸。生物信息学分析表明ELOVL6基因编码的蛋白是跨膜蛋白,具有疏水性,没有信号肽,具有21个磷酸化位点,二级结构以α-螺旋为主。基于ELOVL6基因构建的发育树结果来看,灵丘青背山羊与山羊亲缘关系较近,与家鸡亲缘关系较远。ELOVL6基因在灵丘青背山羊的心、肝、脾、肺、肾、小肠、垂体、皮肤、瘤胃、皮下脂肪、肾周脂肪、下丘脑、甲状腺组织中均有表达,且在肾周脂肪组织中的表达量最高,在睾丸、背最长肌组织中表达较少。
关键词:灵丘青背山羊;超长链脂肪酸延伸酶6;克隆;表达差异;生物信息学
基金资助:山西省重点研发计划项目(201903D221003);山西省重点研发计划项目(2022ZDYF114); 山西省现代农业产业技术体系建设专项(2023CYJSTX14); 山西农业大学科技创新提升工程项目(CXGC2023013)