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作者：陈林;王家乡;吴艳;皮劲松;蒲跃进;
单位：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室;长江大学动物科学学院;湖北省畜牧技术推广总站;
摘要：本文旨在研究鸡卵泡颗粒细胞EGFR基因的功能并对其过表达后进行转录组和生物信息学分析，为进一步研究EGFR基因在鸡卵泡颗粒细胞发育中的调控机制提供理论基础。利用qRT-PCR技术探索EGFR基因过表达后细胞凋亡关键基因（BCL2、c-myc、casp3）以及氧化应激相关基因（SOD2、CYP19、GPX2）的表达量，进而确定其在颗粒细胞中的功能；利用RNA-seq测序技术对EGFR基因过表达后的卵泡颗粒细胞进行转录组学分析，筛选差异表达基因，并对其进行GO和KEGG注释及qRT-PCR验证。在对照组（空载体）和试验组（EGFR基因过表达）颗粒细胞样本中分别获得2.361×107和2.399×107条Clean Reads，其中对照组和试验组共有90.61%的Clean Reads比对到鸡参考基因组上。DESeq分析发现共有1 356个基因在2组间差异表达，其中790个基因上调，566个基因下调，包括与细胞功能相关基因，如SLC2A12、HSPB9、ANO1、CCL4、HMOX1、Nurr1等。GO分析发现，差异表达基因主要富集在转录正调控、DNA模板化、含有核酸酶的化合物代谢的阳性调节以及RNA代谢的正调控等过程。KEGG通路主要富集在类固醇生物合成、溶酶体和局部粘连及细胞外基质受体相互作用等过程。GO和KEGG富集结果表明，EGFR基因过表达后，SLC2A12、HSPB9、ANO1基因表达量显著或极显著上调，CCL4、HMOX1、NR4A2基因表达量显著或极显著下调，推测EGFR基因可以通过调控颗粒细胞中相关基因及信号通路的表达，进而调控卵泡的发育。本研究为分析EGFR基因对卵泡发育的调控机制提供了理论参考依据。
关键词：EGFR基因;转录组测序;蛋鸡;颗粒细胞;差异表达基因
基金资助：国家重点研发计划资助（2022YFD1600100）; 财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系资助（CARS-40、CARS-41）
