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作者:冉彬;程远志;张静;刘子洋;孙培媛;李洪有;
单位:贵州师范大学生命科学学院荞麦产业技术研究中心;
摘要:【目的】对苦荞(Fagopyrum tataricum)的ZF-HD基因进行克隆和表达模式的分析,为进一步探究其对苦荞生长发育相关功能影响提供理论依据。【方法】通过逆转录PCR(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)技术克隆苦荞的FtZF-HD1基因,并对其进行生物信息学和实时荧光定量PCR(qPCR)分析。【结果】FtZF-HD1基因长度为606 bp,编码201个氨基酸;在FtZF-HD1蛋白的C端和N端分别具有同源异形盒和锌指结构域。系统进化分析表明,FtZF-HD1蛋白属于含有锌指结构域的ZF-HD亚家族蛋白,与拟南芥中的ZFHD1蛋白亲缘关系最近。亚细胞定位预测结果表明,FtZF-HD1蛋白定位于细胞核。qPCR分析表明,FtZF-HD1在苦荞不同组织均有表达,在籽粒中相对表达量最高,且在不同发育时期籽粒中的表达呈先迅速上升后缓慢下降并稳定表达的趋势。【结论】FtZF-HD1在苦荞籽粒发育中后期高表达,推测其在苦荞籽粒发育过程中具有重要调控作用。
关键词:苦荞;;FtZF-HD1基因;;基因克隆;;生物信息学分析;;表达分析
基金资助:国家自然科学基金项目(31701494,32260461);; 国家燕麦荞麦现代农业产业技术体系专项资金(CARS-07-A5);; 贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK[2021]重点035)