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作者:杨琳;徐宗乐;崔玮桐;巴丁;样格日;李明婉;陈圆圆;丁申;杨超臣;张党权;赖勇;
单位:河南农业大学林学院;班玛县莲花林场;
摘要:【目的】在核桃(Juglans regia)全基因组范围内鉴定溶血磷脂酸酰基转移酶(lysophosphatidic acid acyltransferase,LPAAT)基因家族,为研究核桃油脂合成、脂肪酸积累的分子机制提供依据。【方法】通过生物信息学分析、预测核桃LPAAT基因家族的特性与功能。并基于核桃幼苗叶片高温胁迫的RNA-seq(RNA sequencing)分析数据,分析了LPAAT基因家族的表达模式。【结果】共鉴定到13个JrLPAAT成员,编码氨基酸大小为248~384aa,且大多数属于疏水蛋白。亚细胞定位分析表明,JrLPAAT基因家族主要位于内质网上;进化树分析将核桃LPAAT基因家族共分为5个亚族,同一亚族内的保守结构域高度相似;跨膜结构域分析表明,JrLPAAT基因家族全部具有跨膜结构;顺式作用元件结果分析表明,JrLPAAT基因家族的顺式作用元件种类丰富,包含多种激素调控类元件、胁迫响应类元件和光响应元件等;种内共线性分析共有5个重复事件;高温胁迫表达显示,除JrLPAAT7、JrLPAAT8,其余均有不同程度的下调表达。【结论】核桃基因组中含有13个JrLPAAT成员,同一亚族内的结构较保守,且受高温胁迫显著影响。
关键词:核桃;;LPAAT基因家族;;油脂合成;;生物信息学分析;;基因表达
基金资助:国家自然科学基金青年基金项目(32001347);; 河南省高等学校重点科研项目(22B220003);; 河南省博士后科研项目(202103078)