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分析化学2025年第09期:基于液相色谱-质谱联用技术的肝癌组织的丙二酰化修饰组学研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:张萌;龙潇;吴燕楠;司浩;王红霞;

单位:宁波大学材料科学与化学工程学院;宁波镇海质谱研究院;

摘要:丙二酰化修饰是一种重要的蛋白质翻译后修饰。为寻找肝癌早期诊断标志物或潜在新药靶点,本研究采用抗体富集结合高性能液相色谱-质谱(LC-MS)联用技术对肝癌患者的癌及癌旁组织的丙二酰化组学进行了系统深入的研究。从肝癌患者样本中共鉴定出1299个修饰肽段,包含1064个修饰位点,对应于511个丙二酰化修饰蛋白。定量分析结果表明,肝癌组织中上调和下调的丙二酰化修饰蛋白分别为56和80个,包含60和101个修饰位点。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析表明,这些差异修饰蛋白参与了代谢途径、脂肪酸降解和糖酵解/糖异生等多种重要通路。作为糖酵解通路关键蛋白,磷酸烯醇丙酮酸羧激酶1(PCK1)在K244位点发生丙二酰化修饰且仅在癌组织中检出。更为重要的是,K244位点是Mn~(2+)的结合位点,并且在不同物种间高度保守。因此,可推测K244位点的丙二酰化修饰会通过影响其与Mn~(2+)的结合进而影响其活性并在肝癌中发挥一定作用,这需要进一步通过位点突变实验进行验证。丙二酰化泛抗的Western blot检测结果表明,与癌旁组织相比,癌组织中的丙二酰化修饰明显降低,与质谱分析结果一致。另外,采用丙二酸钠盐处理肝癌细胞PLC/PRF/5,会显著抑制细胞的生长增殖和侵袭,并增加细胞中蛋白质的丙二酰化修饰。上述结果表明,丙二酰化修饰在肝癌的发生发展过程中发挥了重要作用,其分子机制值得深入研究。另外,本研究发现的136个差异丙二酰化修饰蛋白为进一步研究肝癌的发病机理提供了丰富的候选靶标。

关键词:肝癌;;丙二酰化修饰组学;;液相色谱-质谱联用;;抗体亲和富集

基金资助:宁波市科技局甬江人才工程科技创新领域创新人才项目(No.2023A-148-G)资助~~