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作者:李宁;尹延旭;高升华;王畅;葛长军;谢勇;王飞;姚明华;
单位:蔬菜种质创新与遗传改良湖北省重点实验室·湖北省农业科学院经济作物研究所;黄冈市农业科学院;武汉楚为种业科技有限公司;
摘要:β-淀粉酶(BAM)家族基因广泛存在于多种植物中,在植物生长、非生物胁迫响应等方面发挥重要作用。为进一步挖掘辣椒BAM家族成员信息,探究分析其表达模式及基因功能,利用生物信息学手段对辣椒CaBAM基因家族进行全基因组鉴定,并对基因结构、系统进化及表达模式进行分析。结果表明,辣椒中共有10个CaBAM基因,均为亲水性蛋白,分布于细胞核、细胞质、线粒体、叶绿体和质膜中。系统发育分析将CaBAM基因家族划分为6个组,催化残基Glu-186和Glu-380的保守性高于Flexible loop和Inner loop。CaBAM基因启动子区含有多个与逆境、发育等相关的顺式作用元件,转录组和在低温胁迫下的qRT-PCR验证试验分析表明,CaBAM基因在不同组织和非生物胁迫下存在差异表达,CaBAM4、CaBAM5和CaBAM6可能在辣椒生长发育及逆境胁迫中发挥作用。研究结果为进一步深入研究辣椒CaBAM基因家族功能提供了参考。
关键词:辣椒;;BAM基因家族;;基因表达;;生物信息学
基金资助:湖北省现代农业产业技术体系专项资金资助(2024HBSTX4-06);; 武汉市特派员产学研专项(2023110201030679);; 湖北省农业科技创新中心创新团队项目(2025-620-000-001-01,2025-620-000-001-007)