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作者：薛刚;俞晓荣;施健飞;江峰;王健;吴希;顾杰;石博;李拥军;
单位：南通市海门区长江三角洲白山羊保种繁殖研究所;扬州大学动物科学与技术学院,江苏省动物遗传繁育与分子设计重点试验室;
摘要：本试验旨在探究在circCOL1A1过表达及敲减的毛囊干细胞中差异表达的基因，初步筛选调控长江三角洲白山羊毛囊干细胞生长发育的关键基因。对分离自115～125 d胎龄的长江三角洲白山羊公羔颈脊部皮肤组织的毛囊干细胞进行circCOL1A1的过表达和敲减处理，将处理后的细胞分别进行转录组测序和生物信息学分析，利用STRING等数据库构建多个相互作用网络。通过实时定量聚合酶链反应和Sanger测序进一步验证差异表达基因。结果表明，MYO16、HAPLN4、TBKBP1、CPXM1、TXINP、CSRP2、THEM5基因在circCOL1A1敲减的毛囊干细胞中差异表达，CMTM3、STAT1、MX1、SAMD9、GBP5等基因在circCOL1A1过表达的毛囊干细胞中差异表达；这些基因通过PI3K-Akt、RIG-I样受体（RLR）、JAK-STAT和MAPK-Ras-ERK等信号通路参与毛囊干细胞的生长发育。说明MYO16、HAPLN4、CMTM3、STAT1等差异表达基因主要富集在PI3K-Akt、RLR等通路中，参与调控毛囊干细胞的生长发育等过程。
关键词：长江三角洲白山羊;;circCOL1A1;;转录组测序;;毛囊干细胞
基金资助：江苏省基础研究计划自然科学青年基金项目（BK20230583）;; 江苏省南通市海门区“海门山羊特色品质保持体系构建与应用”项目（HMHT-0905-2023060）
