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作者：张冬杰;马守正;汪亮;刘娣;
单位：黑龙江省农业科学院畜牧研究所;
摘要：为了鉴定新发现的一个长链非编码RNA2099(lncRNA2099)的互作蛋白，试验使用体外培养的猪前脂肪细胞，PCR扩增获得带T7启动子的lncRNA2099体外转录用模板，通过RNA pull down、蛋白质银染及质谱分析的方法对可能与lncRNA2099互作的蛋白进行了筛选与分析。结果表明：PCR扩增和体外转录成功获得了带有生物素标记的lncRNA2099和反义链探针，以反义链探针为阴性对照，lncRNA2099在体外培养的脂肪细胞中共下拉出132个互作蛋白，去掉与阴性对照相同的86个蛋白后，获得46个特异蛋白。根据得分排名，与lncRNA2099互作的蛋白分别是膜联蛋白A2(ANXA2)、肌球蛋白重链2(MYH2)、Y-box结合蛋白(YBX1)和α微管蛋白(α-Tubulin)。说明RNA pull down技术联合质谱分析技术，可鉴定出新发现的lncRNA的互作蛋白。
关键词：猪;;长链非编码RNA2099;;前脂肪细胞;;RNA pull down;;质谱分析
基金资助：国家自然科学基金项目(32172696);; 国创中心先导项目(NCTIP-XD/B01);; 黑龙江省农业科学院创新工程重大项目(CX23ZD06)
