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作者：唐文丹;肖倩;刘宏;孙瑞萍;晁哲;刘海隆;黄丽丽;王峰;
单位：海南省农业科学院畜牧兽医研究所/海南省热带动物繁育与疫病控制重点实验室;海南大学热带农林学院;
摘要：为了鉴定屯昌猪及其不同杂交组合的黑色素皮质受体1(MC1R)基因的遗传变异与毛色表型之间的关联，试验以1月龄体重为4.5 kg的20头屯昌猪(上黑下白)、25头杜屯猪(黑色)、25头川杜屯猪(5头黑色、10头红色、10头白脚黑背)为研究对象，利用PCR扩增和Sanger测序法对屯昌猪及其不同杂交组合MC1R基因型进行鉴定，并与其他毛色猪种的MC1R基因序列进行比较分析。结果表明：以海南野猪、大黑猪和杜洛克猪MC1R基因型作为参考序列时，屯昌猪、杜屯猪、川杜屯猪MC1R基因序列中共鉴定到8个编码区(conding region, CDS)突变，以欧洲野猪MC1R基因型作为参考序列时，发现了一个新的错义突变g.255G>A(V85H),突变率为15%;以杜洛克猪MC1R基因型作为参考序列时，在非翻译区(non-translation region, UTR)鉴定到7个UTR突变，与我国其他地方猪种进行比较时，5′UTR区差异较小，3′UTR区差异较大。屯昌猪、黑色川杜屯猪和白脚黑背川杜屯猪的MC1R基因型为纯合E~(D1),杜屯猪和红色川杜屯猪的MC1R基因存在E~(D1)和e两种基因；红色川杜屯猪与带有黑色毛的猪在95密码子、102密码子和5′UTR的突变频率表现出较大差异，说明MC1R基因CDS和UTR区是关联的，MC1R基因能影响屯昌猪杂交组合的毛色。
关键词：屯昌猪;;杂交组合;;毛色;;MC1R基因型;;SNP
基金资助：海南省地方猪产业技术体系项目(HNARS2023-2-G2)
