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作者：郑星星;李中波;尹会方;
单位：榆林职业技术学院农学院;怀化职业技术学院动物科技学院;龙岩学院生命科学学院动物科技学院;动物源性人兽共患病防控福建省高校工程研究中心;
摘要：为了解陕西省榆林地区鸡异刺线虫的流行情况及其核糖体ITS区、线粒体cox1基因序列进化特征，试验于2022年4—10月份采集榆林市榆阳区、横山区、佳县、米脂县、靖边县、定边县和神木县7个区(县)养鸡场的新鲜鸡粪样本536份(笼养鸡和放养鸡粪便各268份),采用饱和盐水漂浮法富集虫卵，并通过形态学检测鸡异刺线虫虫卵，统计不同区(县)笼养鸡和放养鸡粪便鸡异刺线虫阳性样本数量和阳性率；每个区(县)随机挑选出5只粪检呈鸡异刺线虫阳性的放养鸡(编号为YLHG1～YLHG35),取盲肠内容物提取基因组DNA后对鸡异刺线虫核糖体ITS区、线粒体cox1基因进行PCR扩增与测序，分析核糖体ITS区、线粒体cox1基因序列的碱基组成与遗传差异性，并分别基于鸡异刺线虫核糖体ITS区、线粒体cox1基因构建系统发育树以分析榆林地区鸡异刺线虫的系统发育关系。结果表明：检测到的鸡异刺线虫虫卵外观整体呈淡灰褐色、长椭圆形、轮廓清晰，卵壳光滑且分为明显的内外两层，内含单个尚未分裂的胚细胞；536份新鲜鸡粪样本中共有300份样本检出鸡异刺线虫虫卵，总阳性率为55.97%。其中55份来自笼养鸡，阳性率为20.52%;245份来自放养鸡，阳性率为91.42%。榆林市7个区(县)鸡异刺线虫总阳性率由高到低依次为靖边县(64.10%)、定边县(63.41%)、神木县(57.89%)、佳县(55.81%)、米脂县(51.14%)、横山区(50.0%)、榆阳区(46.77%),笼养鸡阳性率由高到低依次为定边县(31.71%)、靖边县(30.77%)、神木县(23.68%)、佳县(18.60%)、米脂县(15.91%)、榆阳区(9.68%)、横山区(9.38%),放养鸡阳性率由高到低依次为靖边县(97.44%)、定边县(95.12%)、佳县(93.02%)、神木县(92.10%)、横山区(90.62%)、米脂县(86.36%)、榆阳区(83.87%)。PCR扩增出鸡异刺线虫的核糖体ITS区、线粒体cox1基因大小分别为969 bp和1 325 bp。鸡异刺线虫核糖体ITS区基因序列碱基A、T、G、C含量百分比分别为24.6%～25.3%、30.5%～31.5%、24.6%～25.8%和18.6%～19.1%,其中A+T的含量为55.1%～56.8%,G+C的含量为43.2%～44.9%,呈现明显的AT偏好性；鸡异刺线虫线粒体cox1基因序列碱基A、T、G、C含量分别为23.4%～23.5%、42.9%～43.3%、21.2%～21.4%和11.9%～12.4%,其中A+T的含量为66.3%～66.8%,G+C的含量为33.1%～33.8%,呈现明显的AT偏好性。鸡异刺线虫核糖体ITS区基因序列种内差异为0～3.8%,种间差异为20.4%～31.0%;线粒体cox1基因序列种内差异为0～0.9%,种间差异为8.6%～14.6%。基于鸡异刺线虫核糖体ITS区基因构建的系统发育树分为3个分支(分支Ⅰ～Ⅲ)。分支Ⅰ由达荷美异刺线虫(JX845277)、泡状异刺线虫(LC389877)和等矛异刺线虫(KM212953)共同聚类而成；分支Ⅱ由贝拉异刺线虫(LC592733)与印度异刺线虫(LC592806)共同聚类而成；分支Ⅲ由本研究获得的35株鸡异刺线虫(YLHG1～YLHG35)与鸡异刺线虫虫株MPM(LC777441)、HJL10F(LC592784)、HHL19F(LC592776)共同聚类而成，其中鸡异刺线虫虫株YLHG1、MPM(LC777441)、YLHG32～YLHG35聚类成第1个小分支，虫株YLHG30与YLHG31聚类成第2个小分支，其余鸡异刺线虫虫株聚类成第3个小分支。基于鸡异刺线虫线粒体cox1基因构建的系统发育树分为2个分支(分支Ⅰ、Ⅱ)。分支Ⅰ由贝拉异刺线虫(KU529972)、印度异刺线虫(LC592869)与异形异刺线虫(MK024389)共同聚类而成，分支Ⅱ由本研究获得的35株鸡异刺线虫(YLHG1～YLHG35)与鸡异刺线虫虫株YA1(KP308308)、XC1(KP308317)、MY1(KP308325)共同聚类而成。说明陕西省榆林地区鸡群感染鸡异刺线虫情况较为普遍，且7个区(县)鸡群感染的虫株之间存在一定程度的遗传差异性。
关键词：鸡异刺线虫;;核糖体ITS区基因;;线粒体cox1基因;;序列特征;;基因变异;;遗传多样性;;系统发育关系
基金资助：国家自然科学基金区域创新联合基金重点项目(U22A20518);; 湖南省自然科学基金项目(2022JJ50319);; 湖南省教育厅项目(21B1072);; 动物源性人兽共患病防控福建省高校工程研究中心项目(2022K004);; 怀化市科技局重点项目(2023R2208;2020R2206)
