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作者：赵硕;王玲玲;李嘉楠;陈晨;周国英;
单位：中国科学院西北高原生物研究所藏药研究重点实验室;中国科学院大学;
摘要：目的：分析不同生长年限唐古特大黄根转录组变化情况，确定参与蒽醌生物合成的关键基因，以便解析蒽醌类化合物生物合成的分子调控机制。方法：使用高通量测序技术、基因功能注释、同源性搜索和qRT-PCR验证，鉴定参与唐古特大黄蒽醌类化合物生物合成的相关基因。结果：原始数据经组装得到97 499个unigenes, N50为2 371 bp,其中69.42%的基因被注释。不同年限样品中共筛选出7 349个差异表达基因，5年生与8年生之间的差异基因数量更少。有251个unigenes参与蒽醌生物合成途径，其中25个至少在一个对照组间呈现差异表达。利用qRT-PCR验证部分基因表达变化情况同转录组分析结果一致。进一步筛选出8个PKSⅢ基因，其中4个为CHS-like基因，PKSⅢ6和PKSⅢ7在蒽醌积累高峰期显示高表达。结论：初步推测，基因PKSⅢ6和PKSⅢ7可能参与根中蒽醌的积累，该结果将有助于后续唐古特大黄中蒽醌类成分合成机制的研究。
关键词：唐古特大黄;;转录组;;不同生长年限;;蒽醌生物合成;;差异表达基因
基金资助：中国科学院-青海省国家公园联合专项(LHZX-2020-09);; 青海省科技厅成果转化项目(2021-SF-149)
