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中药材2024年第07期:国产5种杠柳属植物的分子鉴定与系统发育分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:黎前利;龙金兰;吴之坤;

单位:贵州中医药大学;

摘要:目的:应用DNA条形码技术对杠柳属5种植物进行分子鉴定,明确杠柳Periploca sepium Bunge、黑龙骨Periploca forrestii Schltr.、大花杠柳Periploca tsangii D.Fang&H.Z.Ling、青蛇藤Periploca calophylla(Wight)Falc.、多花青蛇藤Periploca floribunda Tsiang之间的系统发育关系。方法:采用改良的CTAB法提取5种杠柳属植物的DNA基因组,并利用Illumina HiSeq X-Ten测序平台进行PE150 bp双末端测序,采用最大似然法(Maximum-Likelihood, ML)对ITS2序列及叶绿体基因组序列分别构建系统发育树。结果:5种杠柳属植物的ITS2序列长度为267 bp, GC%为55.7%~56.6%。系统发育树分析表明,5种杠柳属植物聚为单系分支,其中黑龙骨与大花杠柳聚为一支,杠柳与多花青蛇藤聚为另一支,青蛇藤单独为一支。叶绿体基因序列长度范围均在153 513~154 140 bp, GC%为38.1%~38.2%,总基因数为128~132个。系统发育树分析表明,5种杠柳属植物为单系分支,其中多花青蛇藤与大花杠柳构成一单系分支,其余3种植物均为单支。结论:基于ITS2序列的ML树可将杠柳属植物与其他属植物进行区分,属内植物区分的支持率较低;而基于叶绿体基因组建立的ML树可实现杠柳属属内植物的区分,因此,叶绿体基因组较ITS2序列更适合用于杠柳属植物种间的鉴定。

关键词:杠柳属;;分子鉴定;;ITS2序列;;叶绿体基因组;;系统发育

基金资助:国家自然科学基金委员会-贵州省人民政府联合基金项目(U1812403-2);; 贵州省科技计划项目(黔科中引地[2022]4016)