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作者:沈舒楚;吴钰煌;蔡丹;安皓月;伍中宝;王君;杜幼芹;邹黎黎;
单位:三峡大学基础医学院肿瘤微环境与免疫治疗湖北省重点实验室;三峡大学基础医学院感染与炎症损伤研究所;三峡大学第一临床医学院;
摘要:通过同源重组技术敲除大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)外膜孔蛋白C(outer membrane porin channel C,OmpC)编码基因ompC、OmpF编码基因ompF和PhoE编码基因phoE。连续监测ompC缺失株的生长及其对银离子的敏感性;运用生物信息学分析OmpC的生物学特性。结果显示ompC、ompF和phoE缺失株构建成功,ompC、ompF和phoE缺失并不影响E.coli的生长代谢。相比于其他孔蛋白,OmpC蛋白缺失可显著提高E.coli抵御银离子胁迫的能力,与耐抗生素存在差异。生物信息学分析结果表示,OmpC的分子式为C1795H2676N482O577S4,由367个氨基酸组成,相对分子质量为40368.12,原子总数为5534,等电点为4.58;含有跨膜域,定位于细胞外膜中;二级结构中α-螺旋占比18.80%,β-折叠占比29.16%,β-转角占比6.81%,无规则卷曲占比45.23%;与银离子进行分子对接预测显示无对接位点。这为OmpC主要作为银离子入胞通道提供更多证据,可为解析E.coli应对银离子胁迫的机制奠定基础。
关键词:大肠杆菌;λRed同源重组技术;银离子;OmpC;生物信息学分析
基金资助:湖北省自然科学基金项目(2024AFD145,2025AFD256)