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作者：谢华杰;常凯;王艳艳;那琬琳;蔡欢;刘霞;江忠勇;胡宗海;刘媛;
单位：中国人民解放军西部战区总医院检验科;成都市第七人民医院(成都医学院附属肿瘤医院)检验科;
摘要：目的 结合生物信息学分析方法对线粒体翻译起始因子（MTIF2）基因的甲基化特征进行分析，并探讨其与肝细胞癌发生发展的关系。方法 应用MethSurv、EWAS Data Hub软件对MTIF2甲基化样本进行标准化分析和聚类分析，内容包括生存曲线分析、甲基化特征分析、肿瘤信号通路相关性及泛癌数据库比对分析。计量资料两组间比较采用成组t检验；多组间比较采用单因素方差分析，进一步两两比较采用LSD-t检验。使用Cox比例风险模型基于患者CpG部位的甲基化水平执行单变量和多变量生存分析。通过Kaplan-Meier图标识较低和较高甲基化患者组之间的生存差异。Log-likelihood ratio法用于组间生存差异分析。结果 MTIF2甲基化整体聚类表明在种族、人种、BMI、年龄等特征间MTIF2基因甲基化水平没有明显差异。Kaplan-Meier生存曲线分析发现，MTIF2基因N-Shore高甲基化的患者预后明显好于低甲基化患者（HR=0.492,P<0.001），而CpG island和S-Shore甲基化的高低与生存率无明显差异（P值均>0.05）。基于不同年龄、性别、BMI、人种、种族、临床分期绘制MTIF2基因甲基化谱发现，随年龄增长会降低MTIF2基因N-Shore和CpG island的甲基化水平，白种人的MTIF2基因N-Shore的甲基化水平明显低于亚洲人（P<0.05），临床分期Ⅳ期患者MTIF2基因N-Shore和CpG island的甲基化水平明显低于Ⅰ/Ⅱ期患者（P值均<0.05）。临床验证试验表明，Ⅲ/Ⅳ期肝细胞癌患者MTIF2甲基化水平明显低于Ⅰ/Ⅱ期患者（P<0.05），且低于健康人群（P<0.05）。结论 MTIF2基因N-Shore低甲基化是肝细胞癌发生发展的危险因素。
关键词：线粒体翻译起始因子;;甲基化;;癌,肝细胞;;计算生物学
基金资助：四川省自然科学基金（2022NSFSC1415）;; 西部战区总医院应用基础研究项目（2021-XZYG-C22）~~
