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东北农业大学学报2025年第03期:采用机器学习法筛选花鲈鱼中的鲜味肽及其与味觉受体的结合研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:于霞;修孟雪;王松;邸可心;张馨可;

单位:白城医学高等专科学校药学院;

摘要:采用基于机器学习Umami_YYDS(基于化学计量学的鲜味/苦味肽判断网页系统)和分子指纹聚类技术的2种方法,对花鲈鱼中的鲜味肽(能够产生鲜味的肽)进行了筛选与分类.通过对鲜味受体与不同类别鲜味肽的分子对接分析,探讨了各类鲜味肽对鲜味受体的结合偏好与相互作用特性.结果表明:利用NCBI(美国国家生物技术信息中心)的资源,可搜集花鲈的全部蛋白质序列,数量达到3 406条;使用PeptideCutter模块进行模拟后可将花鲈的3 406条蛋白质水解为较小的肽段,主要是2肽和3肽;运用Umami_YYDS精确筛选出110个具有潜在鲜味活性的肽分子;110个鲜味肽分子又被分为3个主要的聚类群体,其中聚类2中的DVR(天冬氨酸-缬氨酸-精氨酸)与3KS9受体的结合能量最低,表明DVR在结构上与受体的匹配度最高,可能产生更强的鲜味感.

关键词:鲜味肽;;花鲈;;机器学习;;分子对接

基金资助:吉林省科技发展计划项目(YDZJ202301ZYTS19,220210101137JC);; 白城医学高等专科学校科研项目(BCGC202413)