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作者:刘玉玺;丛中笑;王浩;
单位:东北农业大学生命科学学院;
摘要:为进一步研究东北油豆角根瘤菌遗传多样性,在东北农业大学校园内取土,种苗捕捉根瘤菌;幼苗长至28~35 d,采集菜豆(Phaseolus vulgaris L.)根瘤,并从中分离纯化根瘤菌11株;利用分子生物学技术和数据统计分析软件,通过对其16S r RNA基因、持家基因(recA、atpD、gyrB、glnⅡ)及结瘤基因(nodC)的PCR扩增、测序、基因序列差异比较及构建系统发育树,全面研究菜豆根瘤菌遗传多样性。结果表明:分离得到11株菌,16S rRNA分为2个聚群,recA、atpD、gyrB、glnⅡ4个持家基因和这4个持家基因串联系统发育树均形成3个聚群,这3个聚群分别由菌株201、202、401、505、613和614聚群形成的分支Ⅰ;以菌株314为代表形成的聚群分支Ⅱ;以菌株310为代表形成的聚群分支Ⅲ。而菌株402、404和504的聚群情况随基因不同而发生变化;菌株402和404在recA、gyrB、glnⅡ和串联基因系统发育树中属于聚群分支Ⅱ,而在atpD基因系统发育树中属于聚群分支Ⅲ;菌株504在atpD、gyrB、glnⅡ及串联基因系统发育树中属于聚群分支Ⅰ,在recA系统发育树中属于聚群分支Ⅱ。全部供试菌株nodC基因与菌株Rhizobium sophoriradicis CCBAU03470T在同一个系统发育分支上。另外,结合recA基因系统发育树和相似性看,以菌株314为代表的分支聚群Ⅱ中的4株菌,与邻近参比菌株Rhizobium croatiense 13T~TrecA序列相似性小于97%,可能为潜在新种。
关键词:菜豆;;根瘤菌;;持家基因;;结瘤基因;;遗传多样性
基金资助:河北省农林科学院国际科技合作项目(2023KJCZX-ZHS-GH01)