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作者：张亚勤;马忠蕊;钱源;李俊君;邓兴力;
单位：普洱市人民医院生殖遗传中心;昆明医科大学第一附属医院产科;云南大学附属医院精准诊疗中心;昆明医科大学第一附属医院神经外科;
摘要：目的 分析唐氏综合征(DS)胎儿羊水外泌体miRNA差异表达谱，为寻找新的DS产前诊断标志物提供依据。方法 收集DS胎儿和染色体正常胎儿羊水，分别提取羊水外泌体进行高通量测序。筛选出差异表达miRNA,使用Targetscan、miRanda进行靶基因预测，筛选出定位在21号染色体上的靶基因，用GeneCards、HGNC、NCBI Gene、UniProtKB/Swiss-Prot、Ensembl、OMIM等数据库查询靶基因相关的生物学功能及相关疾病等。对富集基因的生物学功能进行GO、KEGG分析。结果 共检出59个差异表达的miRNA,其中31个上调，28个下调。以P<0.05为条件对测序结果进行筛选，在变化倍数大于2的差异miRNA中，根据表达丰度从高到低分别筛选出10个上调miRNA,9个下调miRNA。hsa-let-7b-5p、hsa-let-7c-5p、hsa-let-7b-3p＿1ss22CT和hsa-miR-199b-5p是其中的焦点miRNA,BACH1和IFNAR1是它们的交集靶基因。GO分析发现，富集的靶基因主要功能与蛋白质结合、金属离子结合、转移酶活性、DNA结合、RNA聚合酶Ⅱ对转录调控、核苷酸结合等相关。KEGG富集分析结果表明，靶基因主要参与的信号通路包括代谢通路、肿瘤相关通路、PI3K-Akt信号通路、Rap1信号通路等。结论 DS胎儿羊水外泌体miRNA表达与正常核型胎儿存在差异。联合DS胎盘miRNA分析，发现hsa-miR-199b-5p是DS羊水与胎盘共同存在的差异miRNA。推测hsa-miR-199b-5p与hsa-let-7b-5p、hsa-let-7c-5p、hsa-let-7b-3p＿1ss22CT共同的靶基因BACH1和IFNAR1可能参与了DS的病理过程。
关键词：唐氏综合征;;miRNA;;测序;;羊水;;胎盘
基金资助：国家自然科学基金(编号：82360261);; 昆明医科大学生物资源数字化开发应用(2022年度)项目(编号：202002AA100007);; 云南省“兴滇英才支持计划”青年拔尖人才专项(编号：KYQY20210816);; 云南省生殖妇产疾病临床医学中心开放课题(编号：2022LCZXKF-SZ14)~~
