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作者：董梦洁;熊光萍;范佳欣;车如意;唐晓苹;张无敌;庞立丽;章青;孔翔羽;李希希;王宏;李丹地;
单位：传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室,国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;甘肃中医药大学公共卫生学院;
摘要：为了解2021-2022年我国5岁以下儿童中病毒性急性胃肠炎患者HAstV的分子特征及遗传进化规律。对1236份5岁以下急性胃肠炎住院或门诊患儿粪便样本采用实时荧光法筛查HAstV,在HAstV阳性样本中随机选择30例用RT-PCR法扩增并送公司测序,测序成功的HAstV序列利用生物信息学分析软件GenBank、BioAider、MEGA11.0、DNASTAR和BEAST软件对其进行基因分型、遗传进化及贝叶斯分析。2021-2022年我国HAstV阳性率为4.05%(50/1 236),测序获得24条基因序列,鉴定结果显示,HAstV-1为主要基因型(66.67%),其次为HAstV-4(20.83%),HAstV-5(8.33%)和HAstV-2(4.16%)。HAstV-1平均进化率约为6.3×10~(-4)(HPD95%2.2×10~(-4)～1.1×10-3)替换/位点/年;HAstV-4平均进化率约为7.5×10~(-4)(HPD95%4.9×10~(-4)～1.0×10~(-3))替换/位点/年。本研究显示,2021-2022年我国HAstV基因型别多样,HAstV-1和HAstV-4占比较高且进化速率低。本研究了解我国HAstV的遗传变异情况,为今后病毒防控和疫苗的研发提供一定的基础数据。
关键词：星状病毒;分子特征;基因型;平均进化率
基金资助：国家重点研发计划资助（项目号：2022YFC2304302）,题目：呼吸道疾病非注射剂型疫苗研发及靶向递送技术体系研究; 国家自然科学基金（项目号：21934005）,题目：中国母乳糖组高效分离分析及轮状病毒蛋白相互作用研究~~
