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作者：李瑞雪;李承辉;陈俭;李健;南世发;王瑛春;卢德章;肖书奇;殷玉鹏;
单位：西北农林科技大学动物医学院;广西金陵农牧集团有限公司;云南神农农业产业集团股份有限公司;兰州大学兽医学院,中国农业科学院兰州兽医研究所动物疫病预防控制国家重点实验室;
摘要：本文旨在监测广西南宁猪场猪繁殖与呼吸综合征病病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）的流行情况。采集2022年广西壮族自治区南宁市4个不同规模化猪场的9322份血清样品、1348份睾丸液、402份精液样品、3083份唾液样品和787份环境样品，使用qRT-PCR方法对样品中的病原进行检测，同时扩增PRRSV阳性样品的ORF5和NSP2基因；测序后利用DNAStar软件进行遗传进化分析、氨基酸序列比对分析，并对ORF5基因的N-糖基化位点进行预测。从PRRSV阳性样品中成功获得23条ORF5基因序列和18条NSP2基因序列，基于ORF5基因遗传进化分析属于PRRSV美洲型，其中NADC30-like毒株13株，NADC34-like毒株9株，VR2332-Like毒株1株。对ORF5氨基酸进行多序列比对显示，23株毒株无插入或缺失，但都存在位点突变。基于NSP2基因遗传进化分析显示为PRRSV美洲型，对NSP2氨基酸进行多序列比对显示，18株PRRSV存在1+19个氨基酸的缺失，与NADC30毒株NSP2氨基酸对应位置缺失模式一致。结果表明，该地区猪场主要流行NADC30-Like和NADC34-Like毒株，PRRSV不同流行毒株存在一定的遗传差异，本研究为广西PRRS防控和疫苗选用提供了科学依据。
关键词：猪繁殖与呼吸障碍综合征;ORF5;NSP2;遗传进化分析
基金资助：国家重点研发计划：（项目号：2022YFD1800304-06）,题目：PRRSV继发感染过程中黏附相关宿主蛋白的作用机制; 广西南宁市科技局重点研发计划：（项目号：20232059）,题目：规模化母猪场主要腹泻病原综合防控体系研究与示范; 广西金陵研究院：（项目号：K4050722222）,题目：金陵法系后备母猪蓝耳病血清驯化综合防控与示范
