来源：期刊VIP网 时间：
作者：于欣萍;王诗尧;孟庆刚;
单位：北京中医药大学;
摘要：目的 基于生物信息学探究肝癌发生发展的潜在分子机制，筛选并验证鳖甲煎丸对肝癌起调控作用的机制和靶点。方法 下载GEO数据库中的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)单细胞数据，处理后进行通讯分析、富集与代谢分析、细胞亚群再分析。接下来，收集鳖甲煎丸药物成分及作用靶点，结合转录组学结果，确定鳖甲煎丸与HCC的交集靶点并分析。最后，从PDB数据库和PubChem数据库中获取蛋白和小分子信息，模拟药-靶分子对接；通过计算机构建动力学模拟环境，评估交互作用。收集鳖甲煎丸药物成分及作用靶点，分析其与HCC的交集靶点；从PDB数据库和PubChem数据库中获取蛋白和小分子信息，模拟药-靶分子对接；通过计算机构建动力学模拟环境，评估交互作用。结果 转录组学结果显示，HCC癌旁组中细胞间通讯更为活跃；细胞大多富集在细胞周期检查点和免疫反应相关通路；肝细胞代谢活跃，免疫细胞代谢抑制；自然杀伤(natural killer cell, NK)细胞逐渐由具备正常杀伤能力向低杀伤能力演化、肝细胞逐渐由正常肝细胞向癌细胞演化。网络药理学结果显示，鳖甲煎丸调控HCC的潜在作用靶点有124个，大多富集在免疫反应、炎症反应、糖酵解、白介素-17等通路。选择关键蛋白与药物潜在作用靶点进行分子对接，对结合亲和力最强的前三者进行动力学模拟，结果显示这三种受体-配体复合物结合较稳定。结论 HCC细胞可能通过扰乱细胞周期和免疫功能促进其恶性增殖和免疫逃逸；鳖甲煎丸可能通过调节抗炎、免疫反应、细胞分裂等通路达到抗肿瘤效果；关键的药-靶关系在分子对接与分子动力学验证中得到了较好结果，证明其具有较好的亲和力。
关键词：肝癌;鳖甲煎丸;scRNA-seq分析;分子动力学模拟;分子对接
基金资助：国家自然科学基金项目(82174530)
