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中国兽医科学2025年第03期:基于RAA-CRISPR/Cas12a建立牛病毒性腹泻病毒的可视化快速检测方法及其初步应用

来源:期刊VIP网 时间:


作者:热则古丽·艾科拜尔;张亚平;刘浩然;杨莉;马雪连;姚刚;史慧君;付强;

单位:新疆农业大学动物医学学院;新疆草食动物新药研究与创制自治区重点实验室;

摘要:为建立一种基于重组酶介导的扩增技术(RAA)和CRISPR/Cas12a相结合的牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)可视化检测方法。参考GenBank中BVDV 5’UTR基因设计RAA反应的特异性引物和探针,进一步优化RAA-CRISPR/Cas12a反应条件,通过测定灵敏度、特异性和重复性来评估RAA-CRISPR/Cas12a检测方法 。分别使用PCR和RAA-CRISPR/Cas12a对251份犊牛腹泻样品进行了BVDV阳性检测。结果表明,RAA-CRISPR/Cas12a检测方法检测BVDV的最低检测限为3 copies/μL,检测时间为30 min。在对比不同拷贝数阳性样品进行多批次检验后,批内和批间变异系数皆小于5%。用该方法在检测其他牛常见病原微生物时结果均呈阴性,特异性良好。在临床样本检测中,BVDV的PCR阳性检出率为6.37%;同时使用RAA-CRISPR/Cas12a检测时,阳性检出率为29.48%,阳性检出率为PCR的4.63倍。本研究建立了基于RAA-CRISPR/Cas12a的BVDV可视化快速检测方法,对犊牛腹泻的防控具有重要意义。

关键词:牛病毒性腹泻病毒;;重组酶介导等温核酸扩增技术;;CRISPR/Cas12a;;检测

基金资助:新疆维吾尔自治区杰出青年基金项目(2022D01E15);; 新疆维吾尔自治区“天山英才”青年科技拔尖人才专项(2022TSYCCX0049);; 新疆维吾尔自治区重大科技专项(2023A02007-2)