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作者:李金霖;唐振航;李丹蕾;马艺嘉;张红伟;梁爽;
单位:广西中医药大学/广西壮瑶药重点实验室/壮瑶药协同创新中心/广西壮族自治区民族药资源与应用工程研究中心;
摘要:目的:筛选和确定适于鉴别元宝草和贯叶金丝桃的DNA条形码序列,建立可靠的分子鉴定方法以解决元宝草和贯叶金丝桃形态学相似的鉴别难题。方法:从各地收集元宝草和贯叶金丝桃样品20份,提取基因组DNA,选取DNA条形码通用引物ITS2、matK、psbA-trnH及rbcL,按照标准流程扩增各样品。利用双参数模型(K2P)计算种内和种间的遗传距离,并通过邻接法构建系统发育树。应用ViennaRNA Web Services数据库预测该候选序列的二级结构。结果:rbcL、psbA-trnH和ITS2序列均扩增成功且测序成功率达到了100%。经比较,ITS2序列具有最多的变异位点和较高的种间K2P距离,能够区分元宝草和贯叶金丝桃。此外,元宝草与贯叶金丝桃的ITS2、psbA-trnH和rbcL序列的二级结构也存在明显差异。结论:ITS2序列是鉴定元宝草和贯叶金丝桃的首选DNA条形码,而psbA-trnH序列可作为辅助鉴别的条形码,二者组合可有效实现元宝草和贯叶金丝桃物种的真实性鉴定。
关键词:元宝草;;贯叶金丝桃;;DNA条形码;;分子鉴定
基金资助:广西科技基地和人才专项(桂科AD21238031);; 壮瑶药协同创新中心(桂教科研[2013]20号);; 广西重点研发计划项目(桂科AB21196016);; 广西壮瑶药重点实验室(桂科基字[2014]32号)