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作者：罗沙沙;梁一凡;谢玲慧;柴鹏妮;冯航波;宋茗柯;吴长新;陈开超;李基云;陈声;杨志强;
单位：山西大学生命科学学院生物医学研究院医学分子细胞生物学山西省重点实验室;香港理工大学深圳研究院深圳食品生物污染与控制重点实验室;湖南农业大学动物医学院;山西省人民医院检验科;
摘要：为了探究太原市生鲜肉中碳青霉烯耐药大肠杆菌(CREC)的分子流行特征，本试验于2023年7月—2024年1月从太原市2家大型代表性连锁超市采集4个批次共164份生鲜肉类样品，使用选择性培养基分离大肠杆菌；利用微量肉汤稀释法和琼脂二倍稀释法测定分离菌株对临床常用抗生素的敏感性；筛选CREC，开展全基因组二代测序，通过生信分析获得多位点序列分型(MLST)、血清型分型和菌群分型；进一步结合耐药基因和质粒携带情况分析，构建系统发育树。结果显示，样品中大肠杆菌整体检出率为64.02%(105/164)，分离出418株非重复大肠杆菌，其中包含26株CREC，且均为多重耐药菌株。CREC中占比最大的序列型(ST)为ST10(26.92%,7/26)，优势血清型为ONT:H37(11.54%,3/26)。系统发育树结果显示，26株CREC可分为3个进化分支，碳青霉烯类耐药基因主要为bla_(NDM-5)(96.15%,25/26)，值得注意的是，归属于第Ⅲ个进化分支的T4菌株同时携带bla_(NDM-5)和替加环素类耐药基因tet(X4)，而菌株CREC10、CREC12、CREC14和CREC26同时携带bla_(NDM-5)和多黏菌素类耐药基因mcr-1.1。结果表明，太原市生鲜肉中CREC主要流行的ST为ST10，流行血清型为ONT:H37，并发现部分CREC同时携带bla_(NDM-5)和tet(X4)或bla_(NDM-5)和mcr-1.1耐药基因，提示相关机构应当继续加强CREC的流行特征监测。
关键词：碳青霉烯耐药大肠杆菌(CREC);;全基因组测序;;耐药基因;;序列型(ST);;流行特征
基金资助：山西省高等学校科技创新项目（2021L003）;; 太原市“双百攻关行动”第一批“揭榜挂帅”项目（2024TYJB0147）;; 山西省重点研发项目（202102130501023）;; 山西省科技合作交流专项（202304041101005）
