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病毒学报2024年第06期:中华蜜蜂幼虫响应中蜂囊状幼虫病毒感染的MicroRNAs分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李一;肖宇婷;马跃宇;李明;费东亮;马鸣潇;

单位:锦州医科大学畜牧兽医学院;锦州医科大学实验动物中心;

摘要:为了研究中蜂囊状幼虫病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)感染中华蜜蜂幼虫后体内MicroRNAs(miRNA)表达谱变化,探讨差异miRNAs(DEmiRNAs)在中蜂幼虫响应CSBV应答中的功能。本研究分别对感染CSBV24h和48h中蜂幼虫进行Illumina高通量测序,通过生物信息学软件分析DEmiRNAs及其靶基因,并进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。通过RT-qPCR对测序结果进行验证。结果显示:对CSBV感染前后中蜂幼虫测序共筛选出140个已知miRNAs和预测到5个新miRNAs。其中,L24I组(CSBV感染24h幼虫)和L24H组(健康幼虫)对比发现18个DEmiRNAs,其中有12个表达上调,有6个表达下调;L48I组(CSBV感染48h幼虫)和L48H组(健康幼虫)筛选到47个DEmiRNAs,其中有30个表达上调,有17个表达下调。GO分析表明,部分DEmiRNAs及相关靶基因参与免疫系统过程和刺激反应等功能;KEGG通路分析显示,除涉及物质和能量代谢通路外,主要的免疫通路包括MAPK、溶酶体、Hippo、凋亡信号通路等。选取对蜜蜂调控具有重要作用和将要研究的8个miRNAs进行RT-qPCR验证结果表明,结果表明其表达水平与测序结果高度一致,表明测序准确可靠。通过本研究,不仅有助于我们深入认识CSBV感染中蜂幼虫过程中宿主miRNA变化情况,也为探究中华蜜蜂和CSBV相互作用时miRNA发挥的功能提供帮助。

关键词:CSBV;中华蜜蜂;幼虫;MicroRNA;测序

基金资助:国家自然科学基金(项目号:32172789),题目:m6A修饰在中蜂囊状幼虫病毒复制及RNAi免疫调控中的作用与机制研究;国家自然科学基金(项目号:31772760),题目:中华蜜蜂囊状幼虫病毒编码siRNA及其RNAi抑制因子在免疫保护中的作用; 辽宁省自然科学基金(项目号:2022-MS-385),题目:CSBV非结构蛋白3C与宿主互作蛋白的筛选及其功能研究; 锦州医科大学横向课题(项目号:2022043),题目:中国蜜蜂蜂群崩溃失调症流行情况调查研究~~