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病毒学报2024年第06期:2023年宁夏地区HIV-1耐药与分子传播网络特征分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:刘义昌;裴建新;马小发;司冰倩;马春花;李钰峰;朱晓虹;杨东智;吴忠兰;

单位:宁夏医科大学公共卫生学院;宁夏疾病预防控制中心;

摘要:分析2023年宁夏地区HIV/AIDS患者的基因型耐药情况、分子传播网络特征。选取2023年宁夏地区病毒载量>200copies/mL的HIV/AIDS患者的血浆样品进行扩增、测序和基因型耐药监测,判断基因亚型和耐药特征;使用MEGA11软件以TN93模型计算所有序列两两之间的基因距离,以0.013作为基因阈值在Cytoscape 3.9.1中构建分子传播网络。262例样本中亚型以CRF07_BC和CRF01_AE为主;88例发生耐药,总体耐药率为3.01%(88/2 919),以NRTIs-NNRTIs双重耐药(13.74%,36/262)和NNRTIs单纯耐药(13.36%,35/262)为主;107条序列(40.84%,107/262)进入分子传播网络形成18个传播簇,以男性(82.24%,88/107)、26~49岁(58.88%,63/107)、居住于银川市(55.14%,59/107)、异性传播(69.16%,74/107)为主,7种亚型进入网络,CRF01_AE亚型数量最多(59.81%,64/107)。2023年宁夏地区HIV/AIDS患者基因亚型进一步多样化,耐药位点突变类型丰富,以NRTIs和NNRTIs耐药为主,可能已经发生跨地市耐药传播,HIV-1总体流行趋势具有一定聚集性,建议应加强地市间联合干预,结合流行病学资料与分子传播网络技术,识别快速扩张和耐药传播簇,减少HIV-1传播。

关键词:HIV-1;基因型耐药;分子传播网络

基金资助:2017年宁夏青年拔尖人才项目(项目号:宁人社函发[2017]787号); 2020年宁夏回国人员创新创业项目(项目号:宁人社函[2021]5号),题目:核酸定量检测在优化艾滋病一站式早期诊断中的应用