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作者：任大棒;李娟;张建琴;秦雪梅;李彦青;卫罡;张福生;
单位：山西大学中医药现代研究中心;山西药科职业学院;山西中医药大学基础医学院;山西省药品检查中心;山西省医药与生命科学研究院;
摘要：目的：挖掘影响远志次生代谢物生物合成的转录因子。方法：以远志根和茎叶为材料，利用生物信息学软件构建远志2+3代转录组数据库，鉴定含编码区(CDS)的全长远志R2R3-MYB转录因子，筛选远志次生代谢物相关的R2R3-MYB转录因子，并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)进行表达模式分析。结果：远志3代全长转录组获得了20 Gb的Clean data和225 681个非冗余Unigenes,平均长度为2 592 bp; 2代比较转录组获得了17 901个与远志根、茎叶中化学成分差异相关的基因，包括5 337个上调基因，12 564个下调基因。基于上述转录组，共鉴定出18个含CDS全长的R2R3-MYB转录因子，并发现其分布于S1、S3、S4、S6、S7、S11、S18、S20等8个亚族中。经qRT-PCR分析表明，远志R2R3-MYB基因在根和茎叶中的表达具有显著性差异。结论：远志R2R3-MYB中的PtMYB12和PtMYB14正向调节黄酮类，PtMYB7、PtMYB15和PtMYB17正向调节角质层。该研究为后续深入研究远志R2R3-MYB基因家族的调控机制以及远志优良品种的选育提供了理论参考。
关键词：远志;;转录因子;;R2R3-MYB;;生物信息学;;基因表达
基金资助：山西省科技厅应用基础研究项目(201901D111039);; 山西省科技成果转化引导专项(202104021301064);; 吕梁市引进高层次科技人才重点研发项目(2021RC-2-13);; 山西省基础研究计划(201801D221384,20210302123312)
