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作者：牛艺鸣;秦倩;董燕婧;王晓云;熊尚肆;张寿文;
单位：江西中医药大学/中药资源与民族药研究中心;江西省鑫隆农业发展有限公司;
摘要：目的：对不同种群石菖蒲进行遗传多样性和群体结构分析，明确石菖蒲种质之间的遗传背景。方法：以13个不同种群的390份石菖蒲种质为研究对象，基于RAD-seq技术对石菖蒲进行简化基因组测序，并进行SSR标记与引物设计；计算不同种群石菖蒲的遗传多样性参数；利用AMOVA法和UPGMA法进行组间差异性比较和聚类分析。结果：筛选出33对SSR引物，并检测到121个等位基因(N_a),有效等位基因(N_e)平均为3.1146个。遗传多样性评价参数结果显示，平均多态性信息含量(PIC)为0.6033,平均Shannon指数(I)为1.1755,表明石菖蒲群体具有丰富的遗传多样性，且石菖蒲群体内的遗传变异高于群体间的遗传变异；13个不同种群石菖蒲聚为4个不同的群体。结论：该研究结果厘清了不同种质石菖蒲的遗传背景和群体结构，为进一步开展种质评价、育种群体构建和新品种选育提供了科学依据。
关键词：石菖蒲;;种质资源;;SSR分子标记;;遗传多样性;;群体结构
基金资助：江西省中药材产业技术体系建设专项(JX-ARS-11);; 宜春市科技创新券补助项目(宜财教指[2021]144);; 江西中医药大学校级科技创新团队发展计划(CXTD22022)
