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作者:李省;陈霞;杨沛垚;郭艳丽;王丽;马克涛;
单位:石河子大学第一附属医院心脏中心;石河子大学医学院生理学教研室;
摘要:目的 探究基于双硫死亡相关基因构建心力衰竭临床诊断模型的价值。方法 获取训练集基因表达谱系列号(Gene Expression Omnibus Series, GSE)57345的差异表达双硫死亡相关基因,进行基因本体论(Gene Ontology, GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)富集分析、Metascape疾病富集分析。C57BL/6J雄性小鼠6只随机分为对照组和心力衰竭(heart failure, HF)组,每组3只,对照组给予生理盐水腹腔注射,HF组腹腔注射异丙肾上腺素。使用实时荧光定量聚合酶链反应检测关键基因的表达水平。结果GO富集分析主要涉及血小板聚集等方面;KEGG显著富集在紧密接头、血管平滑肌收缩等信号通路。Metascape富集分析显示,差异表达基因主要与局灶性肾小球硬化症、肾小球疾病、血小板疾病、肿瘤浸润、肾病综合征等疾病有关。HF组小鼠心体比表达明显高于对照组,心脏射血分数、短轴缩短率、心排血量、每搏量明显低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。HF组小鼠心脏组织蛋白BNP、基因MYH10 mRNA表达明显高于对照组[1.026±0.501 vs 0.686±0.187,P=0.038;1.469(1.782,2.670)vs 0.360(0.786,1.117),P=0.000],心脏组织基因MYL6、TLN1 mRNA表达明显低于对照组,差异有统计学意义(0.575±0.105 vs 1.000±0.202,P=0.027;0.429±0.114 vs 1.000±0.109,P=0.000)。结论 构建的心力衰竭诊断模型具有较好的诊断性能。
关键词:心力衰竭;;计算生物学;;免疫,细胞;;基因表达
基金资助:兵团指导性科技计划项目(2023ZD001);; 兵团财政科技计划项目(2020AB023)