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作者：张霞;刘永青;王改芳;王海贞;
单位：吕梁学院生物与食品工程系;
摘要：为了研究ZMYND15基因在滇南小耳猪精子发生过程中的生物学功能及表达调控特征，试验采用3头成年滇南小耳猪公猪睾丸组织进行转录组测序(RNA-seq),获得ZMYND15基因在睾丸中的表达量，分析ZMYND15基因特征及蛋白结构与功能，构建系统进化树并对多物种ZMYND15氨基酸序列及邻近基因进行分析，挖掘ZMYND15互作蛋白并对互作蛋白进行GO和KEGG富集分析，对ZMYND15基因进行GO功能注释，预测潜在的调控ceRNA并构建转录调控网络。结果表明：ZMYND15基因相对表达量在RNA-seq和实时荧光定量PCR检测方法中变化趋势一致；ZMYND15基因编码区全长为2 202 bp,含有14个外显子及13个内含子，编码733个氨基酸；蛋白质二级结构无规则卷曲占比最高；含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸3个磷酸化位点；ZMYND15基因在各物种中均具有高度的保守性及同源性；与TEX11、CXCL16和TEX15等多种蛋白相互作用，且主要富集在生物学过程与细胞组分及繁殖性状、雄性生殖细胞核、精子发生和有性生殖等信号通路中；这些信号通路主要涉及精子发生和精细胞发育等方面；ZMYND15基因受到ssc-miR-133b、ssc-miR-150、ssc-miR-24-3p和ssc-miR-34a的靶向调控。说明ZMYND15基因在滇南小耳猪精子发生过程中具有一定的调控作用。
关键词：ZMYND15基因;;精子发生;;滇南小耳猪;;转录调控;;ceRNA网络
基金资助：山西省基础研究计划项目(202403021222371);; 山西省高等学校科技创新项目(2022L570,2021L571);; 吕梁市引进高层次科技人才计划项目(2023RC26)
