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作者：王畅;王冰洁;张开源;常乐彬;韩雪蕾;李新建;李秀领;余彤;乔瑞敏;原黎伟;张永前;杨峰;柏峻;王腾飞;
单位：河南农业大学动物科技学院;海南省农业科学院三亚研究院;河南省谊发牧业有限责任公司;
摘要：为了研究猪背最长肌中circME1的分子特征，并预测其在脂肪沉积调控网络中的功能机制，基于前期研究中确山黑猪和大白猪背最长肌的RNA测序数据，试验选定测序数据中差异表达的circME1作为研究对象，采用PCR扩增、Sanger测序和RNase R消化等方法对circME1的环状结构进行鉴定，采用核质分离和实时荧光定量PCR分析其生物学特性，利用miRanda和Target Scan预测miRNA结合位点，基于GO功能和KEGG通路富集分析结果构建circME1-miRNA-mRNA调控网络。结果表明:猪circME1是由ME1基因上第5个与第7个外显子构成的环状结构，具有较强的RNase R酶抗性，主要分布在细胞质中。circME1包含6个开放阅读框(ORF)、2个内部核糖体进入位点(IRES)和1个m6A甲基化修饰位点，circME1通过海绵吸附miR-455-3p、miR-6782-3p和miR-769-5p调控MAPK和PI3K-AKT信号轴。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示，circME1的靶基因主要富集在膜结合的细胞器等相关条目及MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路和肌动蛋白细胞骨架的调控通路等。circME1在背部脂肪中的相对表达量明显高于背最长肌组织，其中确山黑猪背最长肌和背部脂肪中circME1相对表达量显著或极显著高于大白猪(P<0.05或P<0.001)。说明circME1通过内源竞争RNA机制协同调控脂肪生成生物调控功能，为猪脂肪沉积的转录后调控机制提供了新视角，对优质猪肉分子育种具有重要应用价值。
关键词：猪;;circME1;;亚细胞定位;;脂肪沉积;;ceRNA网络
基金资助：国家重点研发计划项目重点专项“农业生物重要性状形成与环境适应性基础研究”(2024YFF1000203);; 国家“十四五”重点研发计划项目(2021YFD1301202);; 河南省生猪产业技术体系项目(HARS-22-12-G4);; 河南省农业良种联合攻关项目(2022020101)
