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作者:吕雪峰;邢巍婷;郑文新;叶尔兰·谢尔毛拉;赛迪古丽·赛买提;王乐;
单位:新疆维吾尔自治区畜牧科学院畜牧业质量标准研究所;
摘要:为了解博格达绒山羊群体结构和遗传多样性,试验采用山羊Illumina 65K SNP芯片对96只博格达绒山羊群体遗传多样性、近交程度、遗传距离和家系结构进行分析。结果表明:博格达绒山羊单核苷酸多态性(SNP)数量质量控制后为51 480个,有效群体含量(Ne)为11.8,多态性标记比例(PN)为0.902,群体平均期望杂合度为(He) 0.379,观察杂合度(Ho)为0.364,平均多态信息含量(PIC)为0.284;共检测到1 545个连续性纯合片段(ROH)片段,平均长度为127.83 Mb,91只绒山羊的ROH片段长度在0~500 Mb之间;通过ROH计算的群体平均近交系数为0.052,状态同源(IBS)平均遗传距离为0.307 7;群体可以划分为14个家系。说明博格达绒山羊群体处于中度多态水平,遗传多样性较高,存在一定程度的近交,家系数量较多,但大部分家系公羊数量少,需要制订科学的选配计划,引入新的公羊品种或血统,以增加种群的遗传多样性。
关键词:博格达绒山羊;;SNP芯片;;ROH;;遗传多样性;;遗传结构
基金资助:国家重点研发计划项目(2022YFD1300204);; 国家绒毛用羊产业技术体系项目(CARS-39-20);; 新疆维吾尔自治区“三农”骨干人才项目(2022SNGGNT093)