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作者：肖颖;李利利;谭志熹;刘远;李金松;段招军;
单位：广州市荔湾区疾病预防控制中心;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;
摘要：为了解2023年广州市荔湾区诺如病毒胃肠炎暴发/聚集性疫情的毒株分子特征和遗传变异性，收集患者肛拭子，采用qPCR、RT-PCR分别进行诺如病毒检测与分型，并对部分样本进行全基因组测序。对序列进行系统发育分析、氨基酸序列比对、蛋白质理化性质预测，研究其分子特征及不同型别病毒的遗传变异性。结果共有14起诺如病毒疫情，共收集285份标本，其中76份诺如病毒阳性；包括9起GⅡ，2起GⅠ，3起GⅠ/GⅡ混合；成功分型8起疫情，GⅡ.17[P17]型疫情数最多。测序获得LW01(GⅠ.4[P4])、LW06(GⅡ.3[P12])、LW07(GⅡ.17[P17])毒株的全基因组序列，并建立这3种基因型数据集，其中GⅡ.17[P17]型病毒的易突变位点最多。3株毒株均未发现基因重组，均存在新的变异位点，多与氨基酸疏水性相关。本研究中，GⅡ.17[P17]是主要流行基因型，表现出高度遗传变异性。3种基因型毒株均存在氨基酸突变位点，需持续开展诺如病毒分子特征研究以监测其变异趋势，为诺如病毒疫情防控提供科学依据。
关键词：胃肠炎疫情;;诺如病毒;;全基因组测序;;氨基酸变异
基金资助：北京市自然科学基金-海淀原始创新联合基金项目(项目号：L232011),题目：我国诺如病毒基因变异变迁及所致胃肠炎流行特征和经济负担研究~~
