来源:期刊VIP网 时间:
作者:孙嘉文;亓娜;赵宝添;丁小满;刘辉;吕燕;
单位:济南市疾病预防控制中心微生物检验所;山东大学附属济南市疾病预防控制中心微生物检验所;
摘要:分析济南市2019-2024年儿童感染呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus, RSV)的流行趋势和分子流行病学特点及RSV G基因序列的变异情况,为RSV引起的呼吸道感染的预防控制提供科学数据。2019年3月-2024年2月,在济南市某儿童医院每周采集0~14岁儿童流感样病例鼻咽拭子样本,采用多重荧光定量PCR技术进行多病原核酸检测,对符合测序标准的RSV阳性样本进行G基因片段测序。运用描述流行病学方法对采集的数据进行统计分析,使用Mega 11.0软件构建系统发育树,DNAstar软件进行一致性分析,NetNGlyc1.0、NetOGlyc-4.0在线软件进行糖基化位点预测。2019年3月-2024年2月RSV的检出率为7.08%(85/1200);年龄分布上以幼儿(1~<3岁)年龄组最高(8.71%,37/425),各年龄组阳性率之间差异无统计学意义;在季节分布上冬季最高(10.67%,32/300),RSV在不同监测年度及季节间的阳性率差异均有统计学意义。测序得到69株RSV G基因序列(A亚型30株,B亚型39株),A亚型均为ON1基因型,多数毒株发生H258Q和H266L突变(83.33%,25/30);B亚型均为BA9基因型,均发生P262T、T288I、F297S和T310I突变(100%,39/39)。2019年3月-2024年2月,济南市RSV发病具有明显季节特征,ON1型和BA9型为RSV A、B亚型的流行株,本地株与参考株相比出现多个高频氨基酸突变位点,提示应加强RSV分子流行特征的持续动态监测。
关键词:呼吸道合胞病毒;;流感样病例;;分子流行病学;;系统发育分析;;突变
基金资助:济南市卫生健康委员会科技发展计划项目:(项目号:2024307004),题目:宏基因组测序对SARI病例诊断及监测的价值研究;济南市卫生健康委员会科技发展计划项目:(项目号:2024307002),题目:鼻病毒A53血清型感染H1-HeLa细胞差异蛋白谱研究~~