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作者：董宁宁;张琦;谈晓梅;孙亚娟;李传峰;朱杰;汤傲兴;张达;刘光清;李永畅;孟春春;
单位：新疆农业大学;中国农业科学院上海兽医研究所;
摘要：本研究对猫DDX20的CDS区进行克隆、比对不同物种DDX20核苷酸序列和氨基酸序列，构建系统发育树，利用ExPASy ProtParam、DeepTMHMM等软件或在线工具对DDX20蛋白理化性质、二级结构等进行预测分析，并在mRNA水平上判断猫杯状病毒(FCV)对猫DDX20的影响。结果表明：成功克隆出猫DDX20基因CDS区，并上传GenBank，获得登录号：OR237969；生物信息学分析结果显示，猫DDX20蛋白为亲水性蛋白，无跨膜螺旋区和信号肽，有92个潜在的磷酸化修饰位点，3个潜在的N-糖基化位点和7个潜在的O-糖基化位点；亚细胞定位分析显示猫DDX20蛋白主要分布在细胞核(65.2%)；进化分析表明，猫DDX20与老虎和豹子同源性较高；FCV感染会导致猫DDX20的mRNA水平升高，或对病毒的复制产生影响。本研究成功克隆猫DDX20基因CDS区，为后续猫DDX20蛋白功能研究奠定基础。
关键词：猫;;DDX20蛋白;;克隆;;生物信息学分析
基金资助：十四五重点研发计划(2022YFD1800100);; 国家自然基金面上项目(32272982);; 上海市自然基金(23ZR1477100)
