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中国畜牧杂志2024年第04期:不同性别滩羊肌内脂肪沉积相关circRNA的鉴定与筛选

来源:期刊VIP网 时间:


作者:田彦梅;宋昀静;孟科;尤科梅;冯登侦;

单位:宁夏大学动物科技学院;宁夏中卫市沙坡头区畜牧水产技术推广服务中心;

摘要:本文研究了滩羊性别差异对背最长肌肌内脂肪的影响以及circRNA对肌内脂肪的调控,旨在为肉羊的品种改良和育肥提供参考。为了分析不同性别滩羊肌内脂肪沉积的变化,本研究进行转录组测序和分析,以分子机理揭示其肉质的差异。其中肌内脂肪(IMF)沉积的分子机制对羊肉品质的改善具有重要研究意义。使用8月龄滩羊的背最长肌作为研究材料,并采用RNA-seq筛选在2个性别组中差异表达的circRNA,鉴定与这些绵羊IMF沉积相关的circRNA。在鉴定到的6 101个候选circRNA中筛选出了35个差异表达的circRNAs(DECs),通过对其进行分析可知,以滩羊母羊为对照组,8个DECs表达量上调,27个DECs表达量下调。GO功能富集分析结果表明DECs在42个GO条目中显著富集,包括:对Wnt受体信号传导途径的正向调节、骨骼肌收缩、肌肉收缩、脂质结合和大分子分解代谢过程等条目;KEGG通路富集分析结果表明,DECs富集在其他类型的O-聚糖生物合成、蛋白酶体、FoxO信号通路、Jak-STAT信号通路、内吞作用和MAPK信号通路等信号通路中。通过进一步筛选总结出与脂肪沉积有关的circRNA,有novel_circ_0007468、novel_circ_0009311、novel_circ_0008785、novel_circ_0007282、novel_circ_0005618、novel_circ_0005616、novel_circ_0006782、novel_circ_0003269。对6个随机挑选的circRNA进行实时荧光定量PCR验证,其结果的表达趋势与转录组测序结果一致,这进一步验证了测序结果的准确性。本研究为circRNA调控滩羊IMF沉积提供了更多信息,为未来宁夏优质肉羊新品种(系)的培育提供了有用资源和基础资料。

关键词:滩羊;肌内脂肪;环状RNA;性别差异

基金资助:宁夏优质肉羊新品种培育(NXNYYZ20150101)