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作者:肖璐;周泷;吴学婧;于吉锋;谢晶;李兴玉;叶勇刚;魏勇;林毅;曹冶;潘梦;叶健强;毛从剑;康润敏;
单位:四川省畜牧科学研究院动物遗传育种四川省重点实验室;西南民族大学畜牧兽医学院;
摘要:为了解四川省地区猪圆环病毒3型(PCV3)流行毒株的分子及遗传变异规律,试验采用生物学软件,设计3对特异性引物对从四川地区部分养殖场猪群中收集的15份PCV3阳性样品进行分段扩增、全基因序列遗传变异分析。结果表明:PCR分段扩增分别得到大小为623、803和753 bp的条带,阳性克隆菌测序结果与GenBank中PCV3的同源性均大于98.6%;15株样品毒株的全基因核苷酸序列的同源性为98.1%~99.8%,推导氨基酸序列的同源性为95.8%~99.2%,由Cap基因的遗传进化分析发现从四川地区获取的15株PCV3毒株属于3a和3b两个亚群。说明四川地区流行的PCV3毒株至少存在3a和3b 2个亚群,该亚群的变异程度低、较为保守。
关键词:猪圆环病毒3型(PCV3);;序列分析;;遗传变异;;流行病学
基金资助:四川省区域创新合作项目(2022YFQ0024);; 国家现代农业体系四川创新团队建设(Sccxtd-2020-08);; 四川省“十四五”川猪重大科技专项项目(2021ZDZX0010);; 四川省财政运行专项(SASA2014CZYX009)