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作者:李建强;王力伟;常悦;安江红;刘芳;孙华;赵梦然;何江峰;刘永斌;
单位:内蒙古大学生命科学学院;内蒙古自治区农牧业科学院生物技术研究所;内蒙古农业大学动物科学学院;
摘要:为了研究长链脂酰辅酶A合成酶(ACSL)基因家族成员在脂质合成调控中的作用机制,试验以3月龄小尾寒羊为研究对象,利用生物信息学方法对绵羊ACSL基因家族成员的结构和功能进行了研究,对从NCBI数据库中鉴定得到绵羊ACSL家族基因进行理化性质、系统进化、基因结构、蛋白相互作用进行分析,利用荧光定量PCR方法对ACSLs基因在绵羊肋间肌中的表达进行了验证。结果表明:共鉴定得到5个ACSL家庭成员(OaACSL1、OaACSL3、OaACSL4、OaACSL5和OaACSL6),ACSLs家族成员基因定位到绵羊的5条染色体上,分子量在75 909.95~81 923.27 u之间;等电点在6.40~8.84之间,其中OaACSL4等电点最高(为8.84),OaACSL6等电点最低(为6.40)。绵羊ACSL基因家族蛋白均为不稳定亲水性蛋白,蛋白长度为684~734 aa,该家族蛋白结构以无规则卷曲和α-螺旋为主。绵羊ACSL蛋白均与肉毒碱棕榈酰基转移酶1A(CPT1A)蛋白相互作用。系统发育分析结果显示,绵羊与山羊的ACSL基因发育更为接近,OaACSL1和OaACSL6进化关系更接近,绵羊ACSL基因家族序列在哺乳动物进化过程中相对保守。OaACSL1、OaACSL3、OaACSL4、OaACSL5、OaACSL6基因在肋间肌组织中的表达量显著或极显著高于对照组(P<0.05或P<0.01)。说明绵羊ACSL基因家族参与调控脂质合成,OaACSL1和OaACSL6蛋白功能相近。
关键词:绵羊;;ACSL基因家族;;生物信息学;;基因表达;;脂质合成
基金资助:国家肉羊产业技术体系项目(CARS-38);; 内蒙古自然科学基金项目(2023QN03019);; 鄂尔多斯市科技重大专项(ZD20232314);; 内蒙古自治区肉羊产业技术创新推广体系项目;; 内蒙古自治区本级事业单位引进高层次人才科研支持项目