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作者:董贵;张雪;梁德洁;吉尚雷;孟令楠;包文武;王尧;刘衍芬;
单位:塔城职业技术学院;辽宁农业职业技术学院畜牧兽医学院;塔城地区动物疾病控制与诊断中心;
摘要:为了探究腹泻与健康巴什拜羔羊粪便微生物多样性和物种结构,筛选出腹泻巴什拜羔羊的特异性菌群结构,试验采集相同饲养条件下腹泻与健康巴什拜羔羊粪便样本各7份,分别作为腹泻组和健康组,利用16S rRNA高通量测序技术,比较分析腹泻与健康巴什拜羔羊粪便菌群组成、多样性及物种差异。结果表明:腹泻组Abundance-based Coverage(ACE)、Chao1、香浓(Shannon)和辛普森(Simpson)指数均低于健康组,其中ACE和Chao1指数均显著低于健康组(P<0.05)。在门水平上,腹泻组的优势菌门为厚壁菌门、变形菌门、放线菌门,占比分别为49.72%、35.00%、12.15%;健康组的优势菌门为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门、拟杆菌门,占比分别为45.53%、24.14%、16.59%、12.07%。在科水平上,腹泻组的优势菌科分别为链球菌科、肠杆菌科、莫拉式菌科、双歧杆菌科,占比分别为27.68%、16.93%、14.25%、10.56%;健康组的优势菌科分别为莫拉式菌科、肠杆菌科、微球菌科,占比分别为18.64%、18.02%、13.09%。在属水平上,腹泻组的优势菌属为链球菌属、大肠杆菌-志贺氏菌属、不动杆菌属、双歧杆菌属、其他属,占比分别为27.67%、16.92%、14.14%、10.55%、9.18%;健康组的优势菌属为不动杆菌属、大肠杆菌-志贺氏菌属、节杆菌属,其他属,占比分别为18.51%、18.02%、9.35%、20.02%。两组粪便样本在科、属水平中共发现13个显著富集的菌群,腹泻组粪便样本中富集的菌群与健康组存在差异。说明腹泻巴什拜羔羊与健康巴什拜羔羊在粪便微生物多样性方面存在差异。
关键词:腹泻;;巴什拜羔羊;;粪便微生物;;多样性;;比较分析
基金资助:新疆塔城地区“塔城英才”项目;; 塔城地区科技计划指导项目(2024DE1068);; 辽宁省教育厅青年科研基金项目(L201907);; 辽宁农业职业技术学院校级科研课题(Lnz31)