我们的服务符合学术规范和道德
专业 高端让您使用时没有后顾之忧

中药材2025年第11期:一点红EsCuAO基因家族的生物信息及组织表达特征

来源:期刊VIP网 时间:


作者:涂冬萍;蔡文慧;蒋雪梅;杨删;姚金丽;覃艳青;梁柳观;

单位:广西中医药大学创新创业学院;广西中医药大学药学院;中南大学化学化工学院;广西柳药集团股份有限公司;广西中医药大学研究生院;

摘要:目的:通过生物信息学方法,系统分析一点红中铜胺氧化酶基因(EsCuAO)家族的特征及组织表达模式,为进一步利用基因调控技术降低其毒性提供理论指导。方法:从一点红转录组数据中筛选和鉴定出EsCuAO相关基因,并对其理化性质、基因结构、亚细胞定位等生物信息及组织表达特征进行分析。结果:从一点红转录组数据中筛选出12个EsCuAO基因家族成员,均为酸性亲水蛋白;12个成员中有6个是稳定蛋白,4个蛋白具有跨膜结构,2个具有信号肽;预测定位在细胞质、细胞壁、叶绿体、过氧化物酶体等多个部位。蛋白的二级结构均由α螺旋、延长链、无规则卷曲组成,三级结构中包含铜胺氧化酶、苯乙胺氧化酶和过氧化物酶体伯胺氧化酶三种类型;共发现6种保守基序,其中10个蛋白含有铜胺氧化酶超级家族基序。结论:该研究确定的EsCuAO基因可作为后续基因调控研究的重点候选基因,为深入解析EsCuAO基因的生物学功能提供了重要的理论依据和数据支持。

关键词:一点红;;EsCuAO基因家族;;生物信息学;;表达分析

基金资助:广西自然科学基金项目(2023GXNSFAA026331);; 广西中医药大学“桂派杏林青年英才计划”项目(2022C033);广西中医药大学“桂派中医药传承创新团队”建设项目(2022B005)