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作者：刘文波;李思雨;庞燕丽;陈国昌;刘嘉琪;覃建光;覃一峰;陈樱;欧阳康;黄伟坚;黄稳妃;韦祖樟;
单位：广西大学动物科学技术学院;广西壮族自治区兽用生物制品工程研究中心;广西畜禽繁育与疾病防控重点实验室;广西高校动物疫病预防与控制重点实验室;广西农业职业技术大学动物科学技术系;
摘要：为了解广西地区猪圆环病毒3型(PCV3)的流行病学特点及遗传变异情况，本研究对2020—2022年采自广西不同地区屠宰场健康猪组织(肝脏、脾脏、肺脏、淋巴结等)和血清样品68份以及规模养猪场或散养户猪场的病死猪组织和血清样品162份，进行PCR检测。随机选取部分PCV3阳性样品进行全基因测序，并与GenBank中收录的23株参考序列进行比对和遗传进化分析。结果显示：PCV3阳性率为17.83%，对随机选取的24份PCV3阳性样品进行扩增测序，经遗传变异分析国内主要流行PCV3a和PCV3b两个基因型，在14株PCV3a毒株中，其中1株属于PCV3a-1亚型，7株属于PCV3a-2亚型，6株属于PCV3a-IM亚型，另外10株属于PCV3b亚型；2020—2021年，广西流行优势毒株为PCV3a，2022年，PCV3b替代PCV3a成为优势毒株；全基因组相似性分析显示，24株PCV3基因序列与参考毒株的相似性为98.6%～99.8%；对PCV3毒株的Cap蛋白进行氨基酸比较分析，结果显示，Cap蛋白共有4个高突变区，有2个高突变区是位于T细胞抗原表位区，这些突变可能对病毒的感染性和抗原性有所影响；值得注意的是，Cap蛋白的24和27位氨基酸残基的突变与PCV3的分型密切相关。研究结果有助于了解广西地区的PCV3流行情况和遗传进化动态。
关键词：猪圆环病毒3型;;Cap蛋白;;全基因组扩增;;遗传进化分析
基金资助：广西自然科学基金(2018GXNSFDA281021)
