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病毒学报2024年第04期:一起东北黑熊死亡病例的病毒宏基因组学分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:孙政;张如;涂长春;杨艳玲;何彪;

单位:吉林农业大学动物医学院;中国农业科学院长春兽医研究所;中国农业科学院特产研究所;

摘要:黑熊是我国重要的野生动物资源,保护黑熊是我国野生动物保护的重要内容之一。本研究使用常规细菌检测和病毒组学分析,对一起黑熊死亡案例进行病原分析。细菌学检测发现了肠出血性大肠杆菌和A型魏氏梭菌阳性,但结合临床症状,排除了细菌感染的可能。随后使用RNA和DNA病毒组技术相结合,对其进行全病毒组分析,结果发现了Parvovirus、Anellovirus、Circovirus等7个病毒信息,其中肾脏携带的病毒最为丰富,有7个科。在这些病毒中,Parvovirus、Anellovirus和Circovirus与已知病毒核苷酸同源性小于90%,而其余病毒与当前已知病毒同源性高达99%。绝大多数病毒致病性不明确,值得注意的是本研究发现的细小病毒在黑熊中呈现系统感染,且与美国的一株熊细小病毒NS1氨基酸同源性为86.8%,但其与此次黑熊死亡的关联需进一步研究。本研究首次用病毒组技术对黑熊样本病毒组进行分析,结果虽不能判定此次黑熊死亡的原因,但相关数据为了解黑熊病毒多样性提供了重要的基础数据。

关键词:东北黑熊;细菌检测;病毒宏基因组;细小病毒

基金资助:国家重点研发计划(项目号:2023YFF1305401),题目:野生动物疫病高通量精准监测筛查技术建立与病原本底调查研究; 吉林省科技发展计划(项目号:YDZJ202203CGZH051),题目:吉林省肉牛重要疫病关键防控技术研究~~