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病毒学报2024年第04期:2012-2023年度滨州市甲型H3N2流感病毒基因进化特征分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:张丽芳;尹秀升;赵娜娜;张静;黄莹;张美英;

单位:滨州市疾病预防控制中心;

摘要:为分析滨州市2012-2023年流感季节甲型H3N2流感的遗传和抗原特征,本文采集滨州市2012至2023年的流感监测哨点医院流感样病例咽拭子标本进行病毒分离,选取45株甲型H3N2流感病毒代表毒株进行全基因组序列测定,通过生物信息学软件MegAlign, MEGA分析基因进化特征。2012-2023年度监测标本10 137份,季节性流感(甲型H3N2、甲型H1N1、BY系、BV系)病毒总阳性率16.2%,8个年度监测到甲型H3N2流感病毒,阳性率分别为9.6%、1.6%、6.0%、0.1%、10.4%、7.3%、19.0%、8.8%,差异有统计学意义(χ~2=775.902,P <0.001)。45株病毒的全基因组8个片段序列相似性中位数97.2%~99.0%。各片段均位于相应分支,未发现基因重配。HA基因上128(A-T-A-T),131(T-K-T-K),135(T-K-T),138(A-S-A)位点有回复突变现象。2012-2023年度滨州市甲型H3N2流感病毒全基因组序列监测到3次演化,位于4个主要分支,引起分支演化的HA基因的突变位点位于抗原决定簇,抗原漂移是引起分支演化的基础。

关键词:甲型H3N2流感病毒;全基因组序列;同源性;分支演化