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中国畜牧杂志2024年第11期:全基因组关联分析筛选雪山草鸡3个产蛋性状的候选基因

来源:期刊VIP网 时间:


作者:胡进;李东锋;潘在续;许盛海;张康宁;陈国宏;

单位:扬州大学动物科学与技术学院;江苏立华牧业股份有限公司;南京农业大学动物科技学院;

摘要:产蛋性状既关系着种鸡的留种效率,也是养鸡生产中的重要经济性状之一。为了更好地了解雪山草鸡3个产蛋性状的遗传特征,本研究收集了雪山草鸡开产日龄(AFE)、开产至60周龄的合格蛋数(QE)和总蛋数(EN)3个产蛋性状的表型信息,基于系谱和SNP芯片信息分别对其遗传参数进行估计,并使用线性混合模型对3个产蛋性状进行了全基因组关联分析(GWAS)。结果表明:AFE、QE和EN均表现为中低遗传力性状(0.11~0.14),AFE与QE和EN性状间均表现为较低的负遗传相关。针对3个性状的GWAS分析显示,位于1号、3号、8号和11号染色体上的16个候选SNP与其产蛋性状相关;进一步对这16个SNP位点进行注释,筛选出PED3A、SLC30A7、PTGS2和LRX3等基因可以作为产蛋性状的候选基因。本研究首次对雪山草鸡种鸡3个产蛋性状进行大规模GWAS分析,提供了重要的SNP标记位点和候选基因,为雪山草鸡的分子育种实践提供了参考。

关键词:雪山草鸡;产蛋性状;遗传参数;全基因组关联分析;候选基因

基金资助:江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(JBGS[2021]029、BGS[2021]109)