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作者:李亚赛;乔木;吴俊静;张宇;周佳伟;徐忠;冯越;彭先文;梅书棋;杜志强;
单位:长江大学动物科学技术学院;湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室;
摘要:本文旨在筛选与硒都黑猪肌内脂肪(Intramuscular Fat,IMF)含量相关的候选基因和分子标记,为优质猪的培育提供参考。已有研究表明乙醛酸和二羧酸代谢通路参与脂肪酸合成和分解代谢,进而影响IMF含量。针对通路中候选基因MCEE和PCCA进行测序发现2个SNP位点,其中基因MCEE的g.144001513 A>G位点和基因PCCA的g.68930136 G>A位点均位于第1内含子区域,在硒都黑猪群体中进行关联分析,发现2个位点均与IMF性状显著关联。通过基因互作分析发现,与IMF性状相关的候选基因MCEE(g.144001513A>G)和PCCA(g.68930136G>A)互作效应显著。通过蛋白互作预测分析发现,基因MCEE和PCCA所表达的蛋白在猪中共表达。本研究发现位于乙醛酸和二羧酸通路中的MCEE和PCCA基因多态性对硒都黑猪IMF性状有显著影响,可以作为IMF性状选育的重要候选基因,研究结果可为猪IMF沉积提供遗传素材。
关键词:猪;肌内脂肪含量;乙醛酸和二羧酸通路;SNP;关联分析
基金资助:国家重点研发计划青年科学家项目(2022YFF1001300); 湖北省重点研发项目(2022BBA0018); 湖北洪山实验室重大项目(2021hszd003); 湖北省农业科技创新中心创新团队项目(2021-620-000-001-018); 湖北省自然科学基金杰出青年项目(2023AFA091)