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作者:朱慧媛;张朋威;徐硕辉;李瑞婷;高超群;李文婷;蒋瑞瑞;孙桂荣;韩瑞丽;康相涛;李东华;
单位:河南农业大学动物科技学院;河南省家禽种质资源创新与利用重点实验室;
摘要:为了探究类果蝇慢移基因的氨基酸序列特征,探索其在不同肤色鸡不同组织中mRNA表达变化规律,实验采集不同肤色鸡各组织,PCR克隆获得SLMO2完整CDS区,进行生物信息学分析及组织表达分析。实验得到SLMO2的CDS区序列全长560 bp,其中可编码氨基酸174个。生物信息学研究结果表明,鸡SLMO2蛋白并不具有信号肽和跨膜结构,蛋白主要结构以无规性卷曲的α-螺旋结构结合为主,且蛋白分布在线粒体内膜间隙。通过氨基酸序列对比发现,鸡与爪蟾的亲缘关系较近。qRT-PCR结果表明,SLMO2在背肤组织中相对表达量极显著高于其他组织,且该基因在丝羽乌骨鸡背肤组织中表达量极显著高于“豫粉1号”H系鸡。以上结果为进一步探究鸡SLMO2对黑色素沉积的调控机制提供了理论依据。
关键词:鸡;SLMO2基因;CDS区克隆;组织表达;生物信息学分析
基金资助:河南省自然科学基金青年项目(202300410203); 国家自然科学基金项目(32102540); 中原学者首席科学家工作室(30601985)