我们的服务符合学术规范和道德
专业 高端让您使用时没有后顾之忧

中国畜牧杂志2024年第02期:miR-370-3p在绵羊中的表达、生物信息学分析与靶基因预测

来源:期刊VIP网 时间:


作者:王丹;张双双;贾琪;张新玉;付佳棋;张立春;孙福亮;

单位:延边大学农学院;吉林省农业科学院动物生物技术研究所;

摘要:本研究以新吉细毛羊和小尾寒羊为实验动物,用实时荧光定量PCR检测miR-370-3p在绵羊不同组织中的表达变化;利用Mega11.0对miR-370-3p进行序列分析,并构建进化树;利用miRBase对脊椎动物的miR-370-3p序列进行检索,使用Ensembl数据库对miR-370-3p进行定位;利用在线网站预测miR-370-3p的靶基因,并进行GO、KEGG分析。组织表达结果显示,miR-370-3p在2种绵羊1月份和10月份的皮肤组织中均存在显著差异;在2种绵羊同组织间均存在显著差异。miR-370-3p序列主要存在于哺乳动物,且在不同物种间高度保守;miR-370-3p共有315个靶基因;GO分析结果显示靶基因主要富集在蛋白质的自磷酸化、细胞核与细胞质的运输、神经元凋亡过程等方面;KEGG通路分析表明靶基因主要富集到MAPK信号通路、寿命调节通路和细胞内吞作用等,其中多个与毛囊生长发育相关的基因富集到相关通路之上。绵羊miR-370-3p在皮肤组织存在时空表达差异,在各组织间广泛表达,可能通过靶向MAPK信号通路及寿命调节等通路参与调控毛囊的生长发育。

关键词:绵羊;miR-370-3p;靶基因;表达分析;生物信息学

基金资助:国家自然科学基金项目(32060781); 吉林省教育厅项目(JJKH20220543KJ)